作者の説明によると「農大で菌とウイルスとすこしばかりの人間が右往左往する物語」である。
東京にあるとされる「某農業大学」に入学した、「菌の存在」を知覚できるという不思議な能力をもつ主人公・沢木惣右衛門直保をめぐる学園ドラマである。（第５巻収録の第49話冒頭に於いて、「ミニマムな団体劇」とも表現されている）沢木が知覚する「菌」の存在は、かわいらしくデフォルメされたキャラクターとして描かれており、その造形で女性や若年層のファンも多く惹きつけている。作者のウェブサイトにあるBBSには「子供も読んでいるので成人向けの描写は避けて下さい」というような内容の投稿も確認されている。
人間以外の生物（ウイルスを生物に含めるかについては異論があるが）に明確な人格が与えられ雄弁に喋る、特色あるキャンパスを舞台にしている、メインキャラクターに個性の強い教授、大学院生がいるなどの共通点からしばしば『動物のお医者さん』と比較対照されることがあり、共通のファンも多い。作中で菌たちがたびたび発するセリフ「かもす（醸す）」（繁殖する（発酵、腐敗させる）ことを意味する言葉）は作品のシンボル的フレーズとなっている。
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